ASCO 2026 Hereditary - Wong: Liquid Biopsy

Lời diễn giả (EN)Speaker (EN) Bản dịch tiếng Việt
Slide 1
00:00
Hereditary / Liquid BiopsySlide 1
Lời diễn giả (EN)
He gave a really good introduction, so I'm not really going to go over too much of my introduction.
Anh ấy đã có một bài giới thiệu rất hay, vì vậy tôi sẽ không đi sâu quá nhiều vào phần giới thiệu của mình.
Slide 2
00:16
Hereditary / Liquid BiopsySlide 2
Lời diễn giả (EN)
because we all know that cancer is one of the leading causes of death and has a very high global incidence.
bởi vì tất cả chúng ta đều biết rằng ung thư là một trong những nguyên nhân gây tử vong hàng đầu và có tỷ lệ mắc trên toàn cầu rất cao.
Slide 3
00:22
Hereditary / Liquid BiopsySlide 3
Lời diễn giả (EN)
but over time we've gotten very good at treating and the death rate has fallen quite dramatically through advances in therapeutics, but one of the most promising is early detection. You know, if we detect cancer early, the prognosis is much better.
nhưng theo thời gian, chúng ta đã điều trị rất tốt và tỷ lệ tử vong đã giảm khá đáng kể nhờ những tiến bộ trong trị liệu, nhưng một trong những điều hứa hẹn nhất là phát hiện sớm. Bạn biết đấy, nếu chúng ta phát hiện ung thư sớm, tiên lượng sẽ tốt hơn nhiều.
Slide 4
00:40
Hereditary / Liquid BiopsySlide 4
Lời diễn giả (EN)
And so I think one of the, well, I guess everyone here is very, everyone is here for hereditary cancer syndromes, so I think early detection is very successful in patients with hereditary cancer syndromes, and in sporadic cancers, it usually requires two genetic hits to form a cancer, but in hereditary cancers, these patients are born with one hit. There's a genetic variant in one of those genes, and so it only requires that second hit for a cancer to, you know, arise. So these patients develop cancer much earlier and often develop multiple cancers. And so, you know, finding ways that help detect cancer early in these patients really helps with their prognosis. But one of the major kind
Và vì vậy tôi nghĩ một trong những, à, tôi đoán mọi người ở đây đều rất, mọi người đều ở đây vì các hội chứng ung thư di truyền, vì vậy tôi nghĩ rằng phát hiện sớm rất thành công ở bệnh nhân mắc hội chứng ung thư di truyền, và trong các bệnh ung thư lẻ tẻ, thường cần hai cú đánh di truyền để hình thành ung thư, nhưng trong các bệnh ung thư di truyền, những bệnh nhân này được sinh ra với một cú đánh. Có một biến thể di truyền ở một trong những gen đó, và do đó nó chỉ cần cú đánh thứ hai để ung thư, bạn biết đấy, phát sinh. Vì vậy, những bệnh nhân này phát triển ung thư sớm hơn nhiều và thường phát triển nhiều loại ung thư. Và vì vậy, bạn biết đấy, việc tìm ra các phương pháp giúp phát hiện ung thư sớm ở những bệnh nhân này thực sự giúp cải thiện tiên lượng của họ. Nhưng một trong những loại chính
Slide 5
01:29
Hereditary / Liquid BiopsySlide 5
Lời diễn giả (EN)
of limitations is although we have very good screening for a lot of different cancers, not every cancer has that. There's a whole list of, you know, other cancers that can be very hard to detect through your routine screening. And on top of that, there's a lot of barriers to screening uptake. You know, patients that live in more rural areas might not have as much access to these screening methodologies because they have to travel to larger centers to do that routine screening and comprehensive screening.
hạn chế là mặc dù chúng ta có các phương pháp sàng lọc rất tốt cho nhiều loại ung thư khác nhau, không phải loại ung thư nào cũng có. Có cả một danh sách, bạn biết đấy, các bệnh ung thư khác có thể rất khó phát hiện thông qua sàng lọc định kỳ của bạn. Và trên hết, có rất nhiều rào cản đối với việc tiếp nhận sàng lọc. Bạn biết đấy, những bệnh nhân sống ở các vùng nông thôn hơn có thể không có nhiều cơ hội tiếp cận với những phương pháp này phương pháp sàng lọc vì họ phải di chuyển đến các trung tâm lớn hơn để thực hiện sàng lọc định kỳ đó sàng lọc và sàng lọc toàn diện.
Slide 6
02:06
Hereditary / Liquid BiopsySlide 6
Lời diễn giả (EN)
And so, liquid biopsy is one of those very promising technologies that can help with alleviating some of these barriers. And so, because all they require is a simple blood draw. And so, what is a liquid biopsy? So, circulating in your blood are cell-free fragments of DNA. And most of these are derived from your hematopoietic cells. And they're derived through, you know, your normal cells. So, normal cell apoptosis and normal cell turnover will release these fragments of DNA. But also, tumors that are developing will also release this DNA. And so, in general, most of your cell-free DNA is from your normal hematopoietic cells. And a small fraction of it will be from potential tumors that are developing. We call it ctDNA. And so, cell-free
Và vì vậy, sinh thiết lỏng là một trong những công nghệ rất hứa hẹn có thể giúp giảm bớt một số rào cản này. Và vì vậy, bởi vì tất cả những gì họ yêu cầu là một lần lấy máu đơn giản. Vậy, sinh thiết lỏng là gì? Lưu hành trong máu của bạn là các mảnh DNA ngoại bào của DNA. Và hầu hết chúng có nguồn gốc từ các tế bào tạo máu của bạn. Và chúng có nguồn gốc thông qua, bạn biết đấy, các tế bào bình thường của bạn. Vì vậy, quá trình chết theo chương trình của tế bào bình thường và sự thay mới tế bào bình thường sẽ giải phóng các mảnh này của DNA. Nhưng các khối u đang phát triển cũng sẽ giải phóng DNA này. Và vì vậy, nói chung, hầu hết DNA ngoại bào của bạn là từ các tế bào tạo máu bình thường. Và một phần nhỏ trong đó sẽ đến từ các khối u tiềm tàng đang phát triển. Chúng tôi gọi nó là ctDNA. Và vì vậy, DNA ngoại bào
Slide 7
02:59
Hereditary / Liquid BiopsySlide 7
Lời diễn giả (EN)
DNA or cfDNA holds actually a lot of information. You can look at the genomic instability looking at these fragments. You can look at mutations that are developing in the tumor. You can also look at DNA methylation, which gives you a clue of where that fragment of DNA is coming from. Is it coming from the breast? Is it coming from, you know, your bone marrow? So, it holds a lot of information that can be salient and informative. But because most of your cell-free DNA floating around
hay cfDNA thực sự chứa rất nhiều thông tin. Bạn có thể xem xét sự bất ổn định của bộ gen bằng cách nhìn vào các mảnh này. Bạn có thể xem xét các đột biến đang phát triển trong khối u. Bạn cũng có thể xem xét sự methyl hóa DNA, điều này cho bạn manh mối về nguồn gốc của mảnh DNA đó. Nó đến từ vú phải không? Nó đến từ, bạn biết đấy, tủy xương của bạn? Vì vậy, nó chứa rất nhiều thông tin có thể nổi bật và giàu thông tin. Nhưng bởi vì hầu hết DNA ngoại bào của bạn trôi nổi xung quanh
Slide 8
03:29
Hereditary / Liquid BiopsySlide 8
Lời diễn giả (EN)
is from your normal cells. So, in general, most of your cell-free DNA is from your normal hematopoietic cells. finding the small amount of tumor-derived cell-free DNA is often like finding a needle in a haystack. And so, it becomes an issue of sensitivity as well as specificity.
là từ các tế bào bình thường của bạn. Vì vậy, nói chung, hầu hết DNA ngoại bào của bạn là từ các tế bào tạo máu bình thường. việc tìm thấy một lượng nhỏ DNA ngoại bào có nguồn gốc từ khối u thường giống như mò kim đáy bể. Và vì vậy, nó trở thành một vấn đề về độ nhạy cũng như độ đặc hiệu.
Slide 9
03:45
Hereditary / Liquid BiopsySlide 9
Lời diễn giả (EN)
So, this is where multi-cancer early detection tests come in. And, you know, we have, for cancers with good screening, you know, there is a point where it's clinically detectable. But there is cell-free DNA shedding prior to detection. So, there's a lot of multi-cancer early detection kind of fits in, or where you would like it to fit in, is right here, right in between the onset of cancer with shedding and the actual clinical limit of detection, where we can actually detect the cancer using routine screening. And so, a lot of these tests, a lot of companies and, you know, centers have started developing these tests. But they all kind of center around the central workflow where you collect the blood sample and you do some sort of sequencing, genetic sequencing. And then, a lot of them kind of deploy some sort of machine learning algorithm to then essentially put out a cancer signal detected versus no detection. And then, from there, you can do follow-up testing.
Vì vậy, đây là lúc các xét nghiệm phát hiện sớm đa ung thư phát huy tác dụng. Và, bạn biết đấy, chúng ta có, đối với các bệnh ung thư có sàng lọc tốt, bạn biết đấy, có một thời điểm mà nó có thể được phát hiện trên lâm sàng phát hiện được. Nhưng có sự phóng thích DNA ngoại bào trước khi phát hiện. Vì vậy, có rất nhiều phát hiện sớm đa ung thư phù hợp, hoặc nơi bạn muốn nó phù hợp, là ngay tại đây, ngay giữa thời điểm ung thư bắt đầu phóng thích và giới hạn phát hiện lâm sàng thực tế, nơi chúng ta thực sự có thể phát hiện ung thư bằng các phương pháp sàng lọc thông thường. Và vì vậy, rất nhiều xét nghiệm này, rất nhiều công ty và, bạn biết đấy, các trung tâm đã bắt đầu phát triển các xét nghiệm này. Nhưng tất cả chúng đều xoay quanh một quy trình trung tâm, nơi bạn thu thập mẫu máu và bạn thực hiện một số loại giải trình tự, giải trình tự gen. Và sau đó, rất nhiều trong số chúng triển khai một loại thuật toán học máy nào đó để sau đó về cơ bản đưa ra một tín hiệu ung thư được phát hiện so với không phát hiện. Và sau đó, từ đó, bạn có thể thực hiện xét nghiệm theo dõi.
Slide 10
04:50
Hereditary / Liquid BiopsySlide 10
Lời diễn giả (EN)
And so, one of the main challenges is balancing your sensitivity with specificity. And so, sensitivity is, you know, how do you balance your sensitivity with specificity? And so, that's something that we really have to look into as far as how you do your sensitivity testing. [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] How well are you at detecting all of your positive patients? And, you know, these curves often overlap. So if you have very high sensitivity, you might actually get a lot of false positives because your healthy population or non-diseased population are popping up. But then there's also specificity. So how well are you making sure that all your negatives are true negatives? And so if you have high specificity, sometimes you'll have false negatives because now some of your population that does have the disease are not coming up as positive. And so looking at, there's a whole array of different companies that have these tests now. A lot of them you can see have prioritized specificity and can have varying ranges of sensitivity.
Và vì vậy, một trong những thách thức chính là cân bằng giữa độ nhạy và độ đặc hiệu. Và vì vậy, độ nhạy là, bạn biết đấy, làm thế nào để bạn cân bằng độ nhạy với độ đặc hiệu? Và vì vậy, đó là điều mà chúng ta thực sự phải xem xét về cách bạn thực hiện độ nhạy của mình xét nghiệm. [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] Bạn phát hiện tất cả các bệnh nhân dương tính của mình tốt đến mức nào? Và, bạn biết đấy, những đường cong này thường chồng chéo lên nhau. Vì vậy, nếu bạn có độ nhạy rất cao, bạn thực sự có thể nhận được rất nhiều kết quả dương tính giả bởi vì quần thể khỏe mạnh hoặc quần thể không mắc bệnh của bạn đang cho kết quả dương tính. Nhưng sau đó cũng có độ đặc hiệu. Vậy bạn đảm bảo rằng tất cả các kết quả âm tính của mình đều là âm tính thật tốt đến mức nào? Và vì vậy nếu bạn có độ đặc hiệu cao, đôi khi bạn sẽ có kết quả âm tính giả bởi vì bây giờ một số người trong quần thể của bạn thực sự mắc bệnh lại không cho kết quả dương tính. Và vì vậy, nhìn vào, hiện có cả một loạt các công ty khác nhau có các xét nghiệm này. Bạn có thể thấy rất nhiều trong số chúng đã ưu tiên độ đặc hiệu và có thể có các phạm vi độ nhạy khác nhau.
Slide 11
05:52
Hereditary / Liquid BiopsySlide 11
Lời diễn giả (EN)
And so I think there's been a lot of hype in the general population, but I think one of the... one of the barriers for applying multi-cancer early detection to the general population is, you know, the general population isn't generally at very high risk for cancer. And even if you have a very high specificity, so like 99.1%, if you screen 100,000 people, that's still 900 people that are popping up as positive. They require additional follow-up and, you know, can potentially exacerbate some of the accessibility challenges. And so, you know, we're really focused on that. But where I think it really excels is in patients with hereditary cancer syndromes because these patients are already going through normal surveillance of whole-body MRIs or breast MRIs. And on top of that, we have longitudinal data, so every time this patient comes in for their routine follow-up, we can get a blood draw and we can look at these signals longitudinally over time.
Và vì vậy tôi nghĩ đã có rất nhiều sự thổi phồng trong dân số chung, nhưng tôi nghĩ một trong những... một trong những rào cản cho việc áp dụng phát hiện sớm đa ung thư cho dân số chung là, bạn biết đấy, dân số chung thường không có nguy cơ mắc ung thư rất cao. Và ngay cả khi bạn có độ đặc hiệu rất cao, chẳng hạn như 99,1%, nếu bạn sàng lọc 100.000 người, vẫn có 900 người cho kết quả dương tính. Họ cần theo dõi thêm và, bạn biết đấy, có thể làm trầm trọng thêm một số thách thức về khả năng tiếp cận. Và vì vậy, bạn biết đấy, chúng tôi thực sự tập trung vào điều đó. Nhưng nơi tôi nghĩ nó thực sự vượt trội là ở những bệnh nhân mắc hội chứng ung thư di truyền bởi vì những bệnh nhân này đã trải qua giám sát thông thường bằng MRI toàn thân hoặc MRI vú. Và trên hết, chúng tôi có dữ liệu theo chiều dọc, vì vậy mỗi khi bệnh nhân này đến tái khám định kỳ, chúng tôi có thể lấy máu và xem xét các tín hiệu này theo chiều dọc theo thời gian.
Slide 12
06:53
Hereditary / Liquid BiopsySlide 12
Lời diễn giả (EN)
And so we kind of did that when I was a postdoc in Toronto, and so looking at, you know, I'm just going to highlight two cases where these patients have Li-Fraumeni syndrome, so they have a germline TP53 alteration. And so this is one patient, a pediatric patient with LFS. And you can see longitudinally we have a few different time points. They have a previous diagnosis of a low-grade astrocytoma. And then we started seeing a creeping up of this cell-free DNA methylation score.
Và chúng tôi đã làm điều đó khi tôi là nghiên cứu sinh sau tiến sĩ ở Toronto, và vì vậy, khi xem xét, bạn biết đấy, Tôi sẽ chỉ nêu bật hai trường hợp mà những bệnh nhân này mắc hội chứng Li-Fraumeni, vì vậy họ có một biến đổi dòng mầm ở gen TP53. Và đây là một bệnh nhân, một bệnh nhi mắc LFS. Và bạn có thể thấy theo chiều dọc chúng tôi có một vài thời điểm khác nhau. Họ có chẩn đoán trước đó là u sao bào độ thấp. Và sau đó chúng tôi bắt đầu thấy sự tăng dần của điểm methyl hóa DNA ngoại bào này.
Slide 13
07:20
Hereditary / Liquid BiopsySlide 13
Lời diễn giả (EN)
They had a normal whole-body MRI. It was negative, no signal. And then that signal remained elevated.
Họ đã có một kết quả MRI toàn thân bình thường. Kết quả âm tính, không có tín hiệu. Và sau đó tín hiệu đó vẫn tăng cao.
Slide 14
07:28
Hereditary / Liquid BiopsySlide 14
Lời diễn giả (EN)
And then at this MRI, they detected an osteosarcoma in the sphenoid bone. And so it really kind of shows that having longitudinal data and seeing this elevation over time, this prolonged elevation, can potentially help augment their routine screening to really help detect these cancers earlier.
Và sau đó tại lần chụp MRI này, họ đã phát hiện một khối u xương ác tính (osteosarcoma) ở xương bướm. Và vì vậy, nó thực sự cho thấy rằng việc có dữ liệu theo chiều dọc và thấy sự gia tăng này theo thời gian, sự gia tăng kéo dài này, có thể giúp tăng cường sàng lọc định kỳ của họ để thực sự giúp phát hiện những bệnh ung thư này sớm hơn.
Slide 15
07:51
Hereditary / Liquid BiopsySlide 15
Lời diễn giả (EN)
And then the second patient, again, we have longitudinal data. They had their routine whole-body MRI. It was negative.
Và sau đó là bệnh nhân thứ hai, một lần nữa, chúng tôi có dữ liệu theo chiều dọc. Họ đã được chụp MRI toàn thân định kỳ. Kết quả âm tính.
Slide 16
07:58
Hereditary / Liquid BiopsySlide 16
Lời diễn giả (EN)
And then we started seeing an elevation of the cell-free DNA signal.
Và sau đó chúng tôi bắt đầu thấy sự gia tăng tín hiệu DNA ngoại bào.
Slide 17
08:02
Hereditary / Liquid BiopsySlide 17
Lời diễn giả (EN)
And then at their next follow-up, we detected leukemia in this patient. And so actually at this time point, this patient already had the routine CBC and their routine surveillance. And there was no kind of evidence of leukemia in their CBC. But on cell-free DNA, we saw this elevated signal. So it's suggesting that cell-free DNA once again can help augment routine screening to really detect these cancers earlier than our current standard. And so using this data, in Toronto, they've actually started a clinical trial looking prospectively now if these patients get cell-free DNA testing or liquid biopsy testing with their routine screening, can they prospectively detect cancers earlier. So that trial is ongoing. I don't think it ends until 2030-ish. But hopefully that data shows a lot of promise and really helps to change the management of these patients.
Và sau đó trong lần tái khám tiếp theo, chúng tôi đã phát hiện bệnh bạch cầu ở bệnh nhân này. Và thực tế tại thời điểm này, bệnh nhân này đã được làm công thức máu toàn phần (CBC) định kỳ và theo dõi định kỳ. Và không có bằng chứng nào về bệnh bạch cầu trong công thức máu toàn phần của họ. Nhưng trên DNA ngoại bào, chúng tôi đã thấy tín hiệu tăng cao này. Vì vậy, điều đó cho thấy rằng DNA ngoại bào một lần nữa có thể giúp tăng cường sàng lọc định kỳ để thực sự phát hiện những bệnh ung thư này sớm hơn tiêu chuẩn hiện tại của chúng ta. Và vì vậy, sử dụng dữ liệu này, ở Toronto, họ thực sự đã bắt đầu một thử nghiệm lâm sàng để xem xét một cách tiền cứu liệu những bệnh nhân này có được xét nghiệm DNA ngoại bào hoặc sinh thiết lỏng cùng với sàng lọc định kỳ của họ hay không, liệu họ có thể phát hiện ung thư sớm hơn một cách tiền cứu hay không. Vì vậy, thử nghiệm đó đang được tiến hành. Tôi không nghĩ nó sẽ kết thúc cho đến khoảng năm 2030. Nhưng hy vọng rằng dữ liệu đó cho thấy nhiều hứa hẹn và thực sự giúp thay đổi việc quản lý những bệnh nhân này.
Slide 18
09:05
Hereditary / Liquid BiopsySlide 18
Lời diễn giả (EN)
And then the last thing for the last few minutes I'm going to talk about is, you know, with all these liquid biopsy tests, there's a lot of technology around AI happening to help with liquid biopsy. And I think the term AI gets thrown around a lot. And I think... What really is AI? AI is kind of an umbrella term that encapsulates a lot of different types of technology. Some, like machine learning, neural networks, or natural language processing like ChatGPT, and also automation through robotics.
Và điều cuối cùng trong vài phút cuối tôi sẽ nói đến là, bạn biết đấy, với tất cả các xét nghiệm sinh thiết lỏng này, có rất nhiều công nghệ xoay quanh AI đang diễn ra để hỗ trợ sinh thiết lỏng. Và tôi nghĩ thuật ngữ AI được sử dụng rất nhiều. Và tôi nghĩ... AI thực sự là gì? AI là một thuật ngữ bao trùm rất nhiều loại công nghệ khác nhau. Một số, như học máy, mạng nơ-ron, hoặc xử lý ngôn ngữ tự nhiên như ChatGPT, và cả tự động hóa thông qua robot.
Slide 19
09:38
Hereditary / Liquid BiopsySlide 19
Lời diễn giả (EN)
And so machine learning isn't really a new thing. We've used it for a very long time. And a lot of the current algorithms for liquid biopsy use machine learning. And machine learning is kind of just fancy statistics. So it's as simple as something like a linear regression. or it can be something like a random forest model, where it's just a bunch of decision trees, yes or no, [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk] [Crosstalk]
Và vì vậy, học máy không thực sự là một điều gì mới mẻ. Chúng ta đã sử dụng nó trong một thời gian rất dài. Và rất nhiều thuật toán hiện tại cho sinh thiết lỏng sử dụng học máy. Và học máy thực chất chỉ là thống kê cao cấp. Vì vậy, nó đơn giản như một cái gì đó giống như hồi quy tuyến tính. hoặc nó có thể là một cái gì đó giống như một mô hình rừng ngẫu nhiên, nơi nó chỉ là một loạt các cây quyết định, có hoặc không, [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói] [Nhiều người nói]
Slide 20
10:01
Hereditary / Liquid BiopsySlide 20
Lời diễn giả (EN)
But where liquid biopsy is kind of starting to step into now is neural networks. So neural networks are a much more, I guess, sophisticated kind of machine learning. And it's much better at identifying complex relationships because it's trying to mimic the neurons in a brain where each neuron is integrating a lot of different inputs and then relaying that information to a lot of other neurons, which then integrate and disperse as well. And so a lot of complex relationships can be gleaned or deciphered using neural networks.
Nhưng lĩnh vực mà sinh thiết lỏng đang bắt đầu bước vào hiện nay là mạng nơ-ron. Vì vậy, mạng nơ-ron là một loại học máy phức tạp hơn nhiều, tôi đoán vậy. Và nó tốt hơn nhiều trong việc xác định các mối quan hệ phức tạp bởi vì nó đang cố gắng bắt chước các nơ-ron trong não nơi mỗi nơ-ron đang tích hợp rất nhiều đầu vào khác nhau và sau đó chuyển tiếp thông tin đó đến nhiều nơ-ron khác, sau đó chúng cũng tích hợp và phân tán. Và vì vậy, rất nhiều mối quan hệ phức tạp có thể được thu thập hoặc giải mã bằng cách sử dụng mạng nơ-ron.
Slide 21
10:40
Hereditary / Liquid BiopsySlide 21
Lời diễn giả (EN)
And so the reason why people are moving towards neural networks is because cell-free DNA, although it is DNA, it actually is non-random in the way it's generated. And so because of this, it actually holds a lot more information than just genomic DNA. And so one of the things is, you know, the DNA in your cells is packaged into chromatin, which helps dictate the cellular identity. And so you have areas of closed chromatin, which have a lot of histones bound, and then you have areas of open chromatin, which is where genes are actively being transcribed. And so when cell-free DNA is generated, closed chromatin actually does not have as much accessibility for nucleases to come and degrade it. Whereas open chromatin will have much more degradation in those areas. And so when you sequence the DNA, you start seeing areas of higher coverage in your closed chromatin regions and then areas of lower coverage in your open chromatin. And so you can start using that to decipher where these cell-free DNA fragments are coming from. There's a new field that's called fragmentomics, and it's kind of made for machine learning and neural networks, so that every single fragment, if you look at the start site and the end site, and where it's mapping in the genome, can give you information on what type of cell is releasing this DNA. And so I think it's a very promising area of research for liquid biopsies.
Và lý do tại sao mọi người đang hướng tới mạng nơ-ron là vì DNA ngoại bào, mặc dù là DNA, nhưng nó thực sự không ngẫu nhiên trong cách nó được tạo ra. Và vì vậy, nó thực sự chứa nhiều thông tin hơn so với chỉ DNA bộ gen. Và một trong những điều là, bạn biết đấy, DNA trong tế bào của bạn được đóng gói thành chất nhiễm sắc (chromatin), giúp quyết định nhận dạng của tế bào. Và vì vậy bạn có những vùng chất nhiễm sắc đóng, có rất nhiều histone liên kết, và sau đó bạn có những vùng chất nhiễm sắc mở, là nơi các gen đang được phiên mã tích cực. Và vì vậy khi DNA ngoại bào được tạo ra, chất nhiễm sắc đóng thực sự không có nhiều khả năng tiếp cận cho các nuclease đến và phân hủy nó. Trong khi đó, chất nhiễm sắc mở sẽ bị phân hủy nhiều hơn ở những khu vực đó. Và vì vậy khi bạn giải trình tự DNA, bạn bắt đầu thấy các vùng có độ phủ cao hơn trong các vùng chất nhiễm sắc đóng của bạn và sau đó là các vùng có độ phủ thấp hơn trong chất nhiễm sắc mở của bạn. Và vì vậy bạn có thể bắt đầu sử dụng điều đó để giải mã nguồn gốc của các mảnh DNA ngoại bào này. Có một lĩnh vực mới gọi là fragmentomics (phân mảnh học), và nó được tạo ra cho học máy và mạng nơ-ron, để mỗi một mảnh, nếu bạn nhìn vào vị trí bắt đầu và vị trí kết thúc, và nơi nó được ánh xạ trong bộ gen, có thể cung cấp cho bạn thông tin về loại tế bào nào đang giải phóng DNA này. Và vì vậy tôi nghĩ đó là một lĩnh vực nghiên cứu rất hứa hẹn cho sinh thiết lỏng.
Slide 22
12:12
Hereditary / Liquid BiopsySlide 22
Lời diễn giả (EN)
And so, you know, there are studies now showing these kinds of machine learning and neural networks in single analyte or single-modal studies for early detection, but I think where things are moving now is integrating multiple modes. So DNA methylation, sequence, and... Sorry, DNA methylation, sequence, and copy number to really increase our sensitivity while keeping our specificity very high as well.
Và vì vậy, bạn biết đấy, hiện có những nghiên cứu cho thấy các loại học máy và mạng nơ-ron này trong các nghiên cứu đơn chất phân tích hoặc đơn phương thức để phát hiện sớm, nhưng tôi nghĩ hướng đi hiện nay là tích hợp nhiều phương thức. Vì vậy, methyl hóa DNA, trình tự, và... Xin lỗi, methyl hóa DNA, trình tự và số lượng bản sao để thực sự tăng độ nhạy của chúng ta đồng thời giữ độ đặc hiệu của chúng ta cũng rất cao.
Slide 23
12:44
Hereditary / Liquid BiopsySlide 23
Lời diễn giả (EN)
And so my key takeaways are, you know, early detection is currently still the best indicator of prognosis, and Multi-Cancer Early Detection assays... They have to balance sensitivity with specificity. You don't want too many false positives, but you also don't want too many false negatives. And so using multi-cancer early detection in patients with cancer predisposition shows promise, and I don't think it will ever replace current screening, because I think the current gold standard screening kind of always has to be in place, but I think that it can help complement and it can help triage patients that are high risk and might require a little bit more screening versus those that are low risk. because they have multiple negative liquid biopsies and might need, you know, less screening. And then AI and machine learning models have been developing very rapidly, and I think cell-free DNA is a very good space to deploy these technologies to, you know, keep on developing better and better tests.
Và vì vậy, những điểm chính của tôi là, bạn biết đấy, phát hiện sớm hiện vẫn là chỉ số tiên lượng tốt nhất, và các xét nghiệm Phát hiện sớm Đa ung thư... phải cân bằng giữa độ nhạy và độ đặc hiệu. Bạn không muốn có quá nhiều kết quả dương tính giả, nhưng bạn cũng không muốn có quá nhiều kết quả âm tính giả. Và vì vậy, việc sử dụng phát hiện sớm đa ung thư ở những bệnh nhân có khuynh hướng ung thư cho thấy nhiều hứa hẹn, và tôi không nghĩ nó sẽ thay thế hoàn toàn sàng lọc hiện tại, bởi vì tôi nghĩ rằng sàng lọc tiêu chuẩn vàng hiện tại luôn phải được áp dụng, nhưng tôi nghĩ rằng nó có thể giúp bổ sung và giúp phân loại những bệnh nhân có nguy cơ cao và có thể cần sàng lọc nhiều hơn một chút so với những người có nguy cơ thấp. bởi vì họ có nhiều kết quả sinh thiết lỏng âm tính và có thể cần, bạn biết đấy, ít sàng lọc hơn. Và sau đó, các mô hình AI và học máy đã phát triển rất nhanh, và tôi nghĩ DNA ngoại bào là một không gian rất tốt để triển khai các công nghệ này, bạn biết đấy, tiếp tục phát triển các xét nghiệm ngày càng tốt hơn.
Slide 24
13:41
Hereditary / Liquid BiopsySlide 24
Lời diễn giả (EN)
Thanks.
Cảm ơn.
LƯU HÀNH NỘI BỘINTERNAL USE ONLY